La organización académica de ESEADE esta determinada por su Estatuto. El Gobierno del Instituto Universitario depende de un Consejo Directivo, quien designa a las autoridades de la casa. La máxima autoridad Académica es el Rector, que cumple sus funciones con la colaboración y asesoramiento del Consejo Académico. ESEADE ha adoptado una estructura interna departamental.
